Les partenaires de l’ISSAT sont :
Au niveau régional
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- Aeropace Valley
- le Conseil Régional Midi-Pyrénées, à travers Espace Midi-Pyrénées et sa vitrine POLARIS,
- le Rectorat de l’Académie de Toulouse Midi-Pyrénées
- la Mairie de Toulouse, ville membre de la CVA,
- le Lycée Pierre Paul Riquet, Lycée de l’Espace de Saint-Orens de Gameville, l’ISSAT étant membre fondateur de la charte du Lycée de l’Espace,
- La Cité de l’Espace de Toulouse,
- Planète Sciences Midi-Pyrénées,
- Science Animation.
Au niveau national
- le GIFAS, Groupement des Industries Aéronautiques et Spatiales,
- les Ministères en charge de l’Education et de l’Enseignement Supérieur.
Au niveau international
- la CVA, Communauté des Villes Ariane,
- l’ISU, International Space University, l’ISSAT en étant partenaire associé,
- le Réseau NEREUS, Network of European Regions Using Space Technologies.